小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,广泛参与调控细菌各方面的功能。由于不同sRNA调控的靶标及其调控机制不相同,多数已鉴定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的调控靶标及调控机制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物调控型RNA研究的热点。
近期,中国科学院武汉病毒研究所陈士云研究员带领的病原细菌学科组在sRNA功能及调控机制研究方面取得进展。该研究以临床重要的机会致病菌——铜绿假单胞菌为对象,通过生物信息学等方法鉴定出依赖于细菌压力耐受因子RpoS的sRNA—RgsA的2个调控靶标:酰基转运蛋白AcpP及全局性调控蛋白Fis;在伴侣蛋白Hfq的辅助下,RgsA通过不完全互补配对方式调控这2个靶标的表达。进一步研究发现,fis mRNA有两个起始密码子,且均受到RgsA的调控,并找到了调控的关键区域。RgsA还通过抑制细菌生长、运动性及促进毒素的分泌,参与调控细菌的毒力及生长等表型。该研究首次将全局性转录调控因子Fis与压力相关因子RpoS通过sRNA的调控联系起来,揭示了细菌在应对外界环境信号及压力条件时,RgsA反馈调控AcpP和Fis这2个靶标的具体机制。
本研究由助理研究员卢培等人完成,论文在线发表在Molecular Microbiology。该研究得到国家自然科学基金青年基金项目(#31300124)的资助。
RgsA 通过反义互补配对直接调控fis及acpP表达
文章链接:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mmi.13458/full
科学研究